Teste shutdown -h ou shutdown -P , para halt ou poweroff . Deve desligar a máquina completamente. Aparentemente, a opção -P é mais segura (o que significa que é mais provável que cause o poweroff em diferentes distribuições Linux), já que é mais explícita e muito menos dependente da implementação.
Na página do manual de shutdown :
-h Requests that the system be either halted or powered off after it has been brought down, with the choice as to which left up to the system.
-P Requests that the system be powered off after it has been brought down.