Você tem que escolher BIOS para inicializar o drive com o Ubuntu. Isso deve ter o gerenciador de inicialização do grub2 instalado no MBR.
Então, depois de inicializar o Ubuntu, execute o os-prober para encontrar todas as suas outras instalações. Quando você instalou, não encontrou as outras instalações, pois as unidades não estavam conectadas.
sudo update-grub