Qual é a versão do ubuntu que você instalou? Se for uma versão anterior ao 13.04, você pode instalar o jupitor para resolver seu problema. Embora isso não te ajude muito, vale a pena tentar.
sudo add-apt-repository ppa:webupd8team/jupiter
sudo apt-get update
sudo apt-get install pyjupiter
sudo apt-get install jupiter-support-eee
O problema de superaquecimento é muito comum entre usuários do ubuntu e muitas pessoas usam diferentes soluções, como desligar placas gráficas dedicadas se gráficos híbridos forem usados, etc. Como você só compartilha VGA, esse método não é aplicável.