Você pode usar este guia para atualizar o Ubuntu 13.04 do Ubuntu 12.10 link
E os meus aplicativos podem estar como estão? Eu terei algum problema de compatibilidade com aplicativos? É possível até mesmo usar um live cd para instalar a versão mais recente do Ubuntu sobre a existente.
Sim, quando você instalar, haverá uma opção para instalar o Ubuntu 13.04 mantendo seus arquivos e programas antigos. No entanto, algumas configurações podem ser redefinidas. Você deve fazer um backup de todos os dados importantes, caso isso seja perdido na atualização.