Talvez o script para configurar permissões adequadas do WordPress será útil no seu caso.
Update1: Se você procura uma solução mais geral para configurar seus hosts virtuais a partir do modelo, considere painéis de controle como o link
O Virtualmin automaticamente configurará o grupo para permissões de domínio, host virtual e arquivo na pasta raiz. Quando você concluir o estágio de desenvolvimento, poderá fazer backup e migrar um domínio com facilidade para o servidor de produção.