Configure é usado principalmente em pacotes usando o sistema de compilação autoconf / automake. Desde que você está instalando um módulo python, um sistema de compilação diferente é usado. O comando relevante para você é
python setup.py
Para instalar em todo o sistema, talvez seja necessário executá-lo com o sudo.
Você pode precisar instalar o pacote python-setuptools primeiro, se ainda não estiver instalado, e também alguns outros pacotes de pré-requisitos, sobre os quais você deve ser informado pelo script de configuração.