O Windows instala a partição de inicialização e o carregador de boot no MBR do conjunto de unidades para inicializar com o BIOS. Ele precisa de uma partição NTFS primária com o sinalizador de inicialização.
Se estiver instalando e você não quiser que o sinalizador de inicialização do conjunto de partições de inicialização seja separado na partição primária do NTFS em que você instalou. Certifique-se de que o BIOS esteja configurado para inicializar a partir dessa unidade. O Windows tem principalmente partição de inicialização separada, para que você possa criptografar a instalação principal. A partição de boot também possui os arquivos de recuperação, então você pode precisar fazer o repairCD ou flash drive separado para reparar o Windows facilmente.
Você pode usar o testdisk para restaurar a tabela de partições, mas os setores que o Windows sobrescreveu serão danificados. Se você tem dados, você não tem backups, então o único recurso é o photorec, que faz parte do testdisk. Mas isso pode ser um processo longo e demorado.