Esse problema não está realmente relacionado ao Ubuntu, pois é uma decisão de design da Microsoft. No entanto, o que você precisa fazer é configurar o Windows 8 para fazer o desligamento adequado em vez de hibernar. A mesma coisa pode acontecer se você tiver NTFS em um cartão de memória USB e retirá-lo sem primeiro desmontá-lo.
É possível que você pode usar ntfsfix -d
, mas também é possível que isso possa prejudicar sua instalação do Windows, então você precisa tomar precauções se quiser testá-lo.