Para se livrar do painel de mensagens, você pode simplesmente removê-lo. Eu também fiz isso e funciona bem:
sudo apt-get remove indicator-messages
Não sei como ocultar o painel de layout do teclado, mas, até onde eu sei, se você remover todos os layouts de kayboard, ele ficará automaticamente oculto.
Edit: Então aqui está como esconder o painel de layout do teclado: Como remover o indicador do teclado?