Suponho que você tenha seguido o artigo vinculado e modificado seu ~/.bashrc . No entanto, ~/.bashrc talvez nunca seja originado quando você estiver executando um comando a partir de um ativador de painel.
Uma maneira fácil de depurar é adicionar date > /tmp/bashrc_sourced ao final do seu ~/.bashrc e verificar se a hora atual é impressa no arquivo quando você chama o ativador do painel.
Nota relacionada: convém consultar keychain , que é especificamente projetado para gerenciar o ssh-agent para você.