Tente remover:
sudo apt-get purge gnome-shell gnome-shell-extensions gnome-tweak-tool
sudo apt-get autoremove
sudo add-apt-repository --remove ppa:gnome3-team/gnome3
sudo add-apt-repository --remove ppa:gnome3-team/gnome3-staging
sudo apt-get update && sudo apt-get upgrade && sudo apt-get dist-upgrade
Reinicie seu computador. E agora, se você quiser o Gnome Shell de volta, basta instalá-lo nos repositórios oficiais (não é necessário adicionar repositórios não oficiais):
sudo apt-get install gnome-shell gnome-shell-extensions gnome-tweak-tool
Se isso não resolver, tente lembrar se você ajustou alguma coisa com o Gnome Tweak Tool e adicione isso à sua pergunta.
[Editar]
Tente
sudo apt-get clean && sudo apt-get update && sudo apt-get upgrade
sudo apt-get install --fix-broken
sudo apt-get install gnome-control-center-unity
em Aparência, altere seu tema de Adwaita para Ambiance. Se tudo correr bem, você poderá instalar o Gnome Shell a partir do repositório oficial.