Você pode iniciar o próprio servidor Minecraft da seguinte maneira:
Navegue até a pasta onde minecraft_server.jar está. Se você não tem, você pode usar o comando wget
:
wget https://s3.amazonaws.com/MinecraftDownload/launcher/minecraft_server.jar
(Nota: eu tenho esse link clicando com o botão direito e "copiar link local" no site oficial do Minecraft)
Você pode então executar o servidor com java -jar minecraft_server.jar
.
Eu não sei como ajudar com qualquer coisa específica da Multicraft, mas isso deve pelo menos colocar seu servidor em funcionamento.