@Alvin, tenho um problema semelhante com a minha Radeon HD4890 em 12.04 LTS /3.5.0-26. O driver OpenSource está funcionando, mas o cartão é barulhento. Eu encontrei este link em askubuntu, mas ainda não tentei por mim mesmo (sorte sobre o sistema está em execução)
Que ajude, boa sorte!