O Wubi não funciona em sistemas UEFI que usam discos GPT. Todo novo computador com o Windows 8 tem uma inicialização UEFI, porque é a única coisa que suporta inicialização segura. Ele funciona bem com o Windows 8 se você inicializar com o BIOS.
Não há solução prática neste momento , além de esperar por uma correção da equipe de instalação do Ubuntu da Canonical. A quantidade de esforço necessária para mudar para uma inicialização de BIOS legada e substituir o disco GPT por uma configuração de tabela de partição MBR negaria todo o ponto do Wubi: instalar e remover facilmente o Ubuntu do Windows (para fins de teste).
De qualquer forma, o suporte ao Wubi foi oficialmente descartado desde 13.04 e não é mais uma opção de instalação suportada para o Ubuntu: Intenção de descartar o Wubi da versão 13.04 .