Acho que o Gnome Documents é, na verdade, apenas uma interface de pesquisa simples para mostrar a lista de documentos em várias origens. Olhando para o código-fonte para gnome-documents
, parece que você provavelmente precisa ter o tracker
instalado e fazer com que ele indexe o conteúdo da mídia removível, bem como o seu diretório pessoal.