É possível que o instalador do Ubuntu não reconheça o Windows ou não inclua o Windows porque ele não estava nessa unidade. Tente executar sudo grub-probe , marcando o que foi dito e tentando reiniciar.
Eu tenho dois HDD um tem o Windows 7 e eu instalei o Ubuntu no segundo HDD quando eu reiniciar não há nenhuma opção do Windows 7?
É possível que o instalador do Ubuntu não reconheça o Windows ou não inclua o Windows porque ele não estava nessa unidade. Tente executar sudo grub-probe , marcando o que foi dito e tentando reiniciar.