Em uma instalação do Wubi, o sistema Ubuntu é apenas armazenado em discos virtuais, que são apenas alguns arquivos do ponto de vista do Windows.
Portanto, copie esses arquivos para uma unidade USB ou algum meio de armazenamento externo.
Agora, formate seu disco e instale o Windows 8.
Agora, usando o Wubi, instale a mesma versão do Ubuntu que você tinha antes, certifique-se de seguir exatamente os mesmos passos de antes de fazer a instalação do Wubi.
Após a instalação, você deve apenas poder trocar os discos virtuais recém-criados pelos Antigos, e você deve ter o sistema de volta.
Se a troca com os discos antigos não for possível, você ainda poderá usar os discos antigos para recuperar dados.
Consulte o Can Montar uma imagem .disk do Wubi em uma nova instalação do Wubi?