Eu tive problemas semelhantes com meus jogos em linux assim. Eu também uso gráficos da Intel.
Eu nunca tive que fazer nada de especial para que eles funcionassem. Tente brincar com as configurações de exibição dos jogos, executando em janela e, em seguida, tentando fullscreen no próximo lançamento. A maioria dos meus problemas parecia se corrigir naquele momento.