Abra seu terminal e execute estes comandos:
wget http://www.unidata.ucar.edu/downloads/netcdf/ftp/netcdf-4.2.1.1.tar.gz
tar -xvf netcdf-4.2.1.1.tar.gz
cd netcdf-4.2.1.1
./configure
make
sudo make install
Para mais informações, no diretório netcdf-4.2.1.1
você terá um arquivo README.