Quando você fez a instalação inicial, você desconectou a unidade de HDD e fez uma instalação limpa no SSD, está correto? A razão que eu perguntei é que eu quero fazer essencialmente a mesma coisa.
Você programa arquivos funcionam corretamente agora? Ou você precisou mover os arquivos de dados para o SSD para que eles funcionassem.
Eu concordo com o que você disse inicialmente é que a nova instalação do Windows 7 criou seus novos arquivos de recuperação no SSD como qualquer nova instalação.
Para abordar a parte sobre o sistema operacional do Ubuntu, você pode configurar uma partição de inicialização dupla se tiver as ferramentas acronis. De acordo com a nova atualização de software, você pode instalar quantos sistemas operacionais quiser colocar em sua partição.
Eu usei-o para clonar um disco inteiro para a cópia do disco e funcionou muito bem. Mas você terá que comprar o Disk Director do Acronis para fazer qualquer coisa importante, mas vale a pena.
Espero que tenha ajudado na sua pergunta. Eu vi o seu artigo e foi de grande interesse para mim estar no processo de fazer alterações semelhantes às configurações do meu sistema.
David