Você pode verificar se existe algum processo que deva consumir todo esse espaço em disco? Aconteceu comigo, ter meu cliente de torrent aberto e ele continua preenchendo o disco. Verifique se você tem o gerenciador de pacotes fazendo download de atualizações no plano de fundo e mate esses processos.
ps -ax #Should list all the processes running, try and find out something, or post here the last lines of the ouput of this command
Espero que isso ajude.
Felicidades