Como o prompt boot:
vem do syslinux e o syslinux é configurado pelo software penndrive, não acho que o procedimento e o software que você usou funcionaram corretamente.
Sugiro que você recrie o pen drive usando esta resposta. Veja também este procedimento de pendrivelinux.com que parece jogo.
O que é suposto acontecer:
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O BIOS deve encontrar o primeiro setor no pen drive, escrito pelo procedimento, e transferir o controle para ele. Isso está funcionando.
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A cadeia de eventos iniciada com essa ação deve carregar o programa syslinux da partição DOS no pen drive. Isso parece estar funcionando também.
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O software syslinux deve encontrar seu arquivo de configuração no mesmo local e deve direcioná-lo para o kernel Linux do Ubuntu no pen drive, talvez colocando um menu primeiro. Eu acho que é aqui que a falha está ocorrendo.
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Com o carregamento do kernel do Ubuntu, o sistema operacional Ubuntu linux / gnu / debian deve iniciar.
Outra referência que pode ser útil é aqui .