Eu tive exatamente o mesmo problema. Como você está recebendo um erro ao parar apenas o Apache e o ProFTP, é necessário excluir esses dois arquivos:
/opt/lampp/logs/httpd.pid
e
/opt/lampp/var/proftpd.pid
Quando você exclui o httpd.pid, o Apache é automaticamente eliminado. E semelhante acontece quando você remove o proftpd.pid.
Então, agora você pode ir em frente e reiniciar o servidor e novos arquivos serão criados. :)