Acabei de passar por isso sozinho. Entendo que o comportamento do painel Unity não é o mesmo que o painel antigo do gnome. Ele mostra apenas applets / indicadores que não são uma bandeja de notificação completa. Meu trabalho é usar o alternador de gerenciador de janela / compiz Cairo-Dock. Isso até que alguém transforme o ícone de fusão em um indicador / applet (se algum dia).