O sistema de arquivos FAT32 possui limitações de tamanho. Você não pode criar uma partição FAT32 maior que 32 gigabytes (GB). Além disso, você não pode armazenar um arquivo com mais de 4 GB em uma partição FAT32.
Fonte: Microsoft
Consulte aqui para mais informações
além de 32 GB
Apesar das limitações do FAT32 em termos de limites máximos de tamanho de arquivo, falta de ACLs e suporte a cotas de disco. Infelizmente, quando o usuário deseja preparar uma unidade para uso dessa maneira, há um grande problema: o Windows não pode formatar unidades e partições maiores que 32 GB em FAT32.
Você pode até considerar fazer uma partição dimensionada em 32 GB inicialmente e redimensioná-la para preencher o restante do espaço vazio. Mas no Windows, o uso das ferramentas básicas de armazenamento para redimensionar operações não é suportado em sistemas de arquivos diferentes de NTFS. 1
1 Fonte: techrepublic.com