Eu usei o link para definir manualmente o dpkg (debconfig) bandeira. Eu tive que usar este comando (nb. Isso é perigoso, não use isso como uma solução de colar e copiar)
echo "set grub-pc/install_devices /dev/disk/by-id/ata-TOSHIBA_MK1646GSX_481JF04DS-part3" | debconf-communicate
Há mais detalhes no link acima, o que deve ajudar com a maioria dos problemas do debconf.
Caso qualquer outra pessoa encontre o problema, há mais detalhes aqui: link