Você pode reinstalar o setor de inicialização (MBR), já que o grub ainda está lá e ativo. Deve haver uma ferramenta no seu disco de instalação do Windows, mas você precisará procurar ajuda do Windows folk e não do Ubuntu para isso. Como alternativa (e provavelmente melhor), você pode instalar o Kubuntu iniciando no live-DVD e não tentando instalar com o wubi. Isso irá restaurar o grub com as configurações corretas depois de ter instalado o Kubuntu. Se você quiser conselhos sobre o wubi, você pode consultar: link