Ok, eu encontrei a solução, mas eu tive que superar alguns obstáculos, eu vou manter isso aqui, caso algum outro ache.
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O alsamixer não funcionava bem no gnome-terminal, não mostrava todos os botões disponíveis e estava mais ou menos inutilizável. A solução para este problema foi chamar o xterm do gnome-terminal e então iniciar o alsamixer no xterm. O xterm funcionou muito bem para o mixer da alsa.
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De alguma forma, eu experimentei muito no mixer alsa. Acho que a solução final foi mudar o dispositivo de captura do microfone digital para o analógico. Em outras palavras, mudei tudo o que dizia "digital" para analógico. E de alguma forma, em um ponto, apenas começou a trabalhar.