Eu tenho o mesmo problema, parece que é um bug no Ubuntu 13.10. Eu recomendo que você tente estas:
sudo add-apt-repository ppa:gnome3-team/gnome3-next
sudo add-apt-repository ppa:gnome3-team/gnome3-staging
Então faça:
sudo apt-get update
sudo apt-get install gdm gnome-panel
tente também "chkdsk / f" no Windows.
se não funcionar, reinstale o Ubuntu 13.10 isso acontece principalmente quando você inicia o Windows.