Ter uma conta administrativa em uma máquina Linux não significa que todos os comandos executados sejam executados automaticamente com permissões completas. Isso seria imprudente e pode até tornar seu sistema inutilizável.
Para executar um comando com acesso total ao sistema de arquivos, você pode adicionar sudo antes do comando. Isso executará o seguinte comando como o usuário raiz real, para que ele obtenha as permissões necessárias.
Exemplo:
sudo cp .bully /
Isso iria copiar o arquivo .bully para o diretório raiz. Isso não funcionaria sem o sudo, já que o diretório raiz não fornece acesso de gravação a ninguém além do usuário root.
Para incluir meu comentário na resposta: Você nunca deve executar um programa com direitos administrativos, se não souber o que está realmente fazendo. Antes de começar a brincar, com o sudo, recomendo que você pelo menos aprenda o uso dos seguintes comandos de cor (incluindo opções):
ls, cd, cat, less, more, grep, rm, mv
Se você puder usar esses comandos corretamente, poderá realizar muitas tarefas a partir do terminal. Somente se você tiver certeza de usá-los, você deve começar a fazer tarefas administrativas com o sudo. Há um bom jogo para aprender a usar comandos Bash: Terminus