Eu diria que o seu post poderia incluir um pouco mais de informação, mas vou apenas lançar isso como uma recomendação que "funciona para mim." YMMV ...
Primeiro: Ao lidar com a formatação geral de uma unidade, gosto de trabalhar a partir de um disco USB, permitindo acesso total à unidade em questão. Se você usar a versão desktop para obter acesso ao gparted ou algo parecido, isso permitirá que você tenha acesso total para alterar as partições, alterar o formato da unidade, etc.
Segundo: O sistema não permitirá que você formate uma unidade que está atualmente montada ... Se você está usando atualmente espaço de troca ou qualquer uma das partições na unidade, é muito provável que você não ...
Terceiro: Se você tem certeza de que não está usando o particiton / drive, e ele ainda está dizendo não ... Você está usando permissões de root (também conhecido como sudo etc.)