Você pode instalar facilmente o GTKTerm a partir do terminal usando sudo apt-get install gtkterm
.
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O que você está vendo é um problema de dependência (por exemplo, ver linhas como aclocal-1.4... missing
). Você precisa instalar todas as dependências que são necessárias antes para poder compilar o GTKTerm, para instalar estas dependências, use isto:
sudo apt-get build-dep gtkterm
Depois de ter feito isso, você poderá executar ./configure
sem problemas.