É provável que a instalação do Windows esteja intacta e inicializável, mas não esteja sendo inicializada porque você ativou o Módulo de Suporte à Compatibilidade (CSM) do seu firmware, também conhecido como "Modo BIOS" ou "modo legado". Se estou certo, desativar o CSM deve corrigir o problema de inicialização do Windows. Detalhes de como fazer isso variam de um computador para outro, por isso não posso fornecer instruções passo a passo.
Se você conseguir que o Windows inicie no modo EFI novamente, sugiro que tente novamente instalar o 64-bit Ubuntu no modo EFI. Veja esta página minha para informações básicas sobre porque usar o CSM é ruim. Essa página também inclui uma seção sobre a criação de USB inicializável por EFI drives, que parece ser o maior obstáculo que as pessoas enfrentam quando tentam instalar o Ubuntu no modo EFI. Observe que a instalação do Ubuntu de 64 bits no modo EFI será uma instalação nova, portanto, sua instalação antiga de 32 bits será completamente eliminada, incluindo os dados do usuário. Se você armazenou arquivos que deseja manter, faça backup deles na mídia externa. Além disso, você pode precisar usar a opção de instalação "Algo mais", conforme descrito em essa pergunta e suas respostas. Se você usar uma das configurações mais automatizadas, poderá acabar com as instalações antigas e novas vivendo lado a lado, mas a antiga provavelmente será inútil ou menos redundante.