De minha própria experiência O instalador do Wubi para Windows funciona melhor com Ubuntu 12.04 LTS e alguns dos outros sistemas operacionais que fazem parte da família Ubuntu, como o Xubuntu 12.04 LTS ou o Lubuntu 12.04 LTS.
Se você planeja testar o Ubuntu primeiro em uma configuração de inicialização dupla com o Windows, o instalador do wubi é uma boa maneira de começar, mas você estará limitado a apenas 30 GB de espaço ao instalar o Ubuntu. Além disso, o Ubuntu irá inicializar rapidamente, e você poderá usar o Ubuntu de uma maneira muito similar ao instalar o Ubuntu em uma partição separada do Linux.
Se você quer jogar com segurança, e não tem planos para mudar sua tabela de partições, adicionando as partições Linux necessárias para instalar o Ubuntu, o instalador wubi é a escolha certa. Uma vez que você se acostumar com este novo sistema operacional, você pode decidir mais tarde instalar o Ubuntu 14.04 dentro de uma partição real do Linux.
Recomenda-se fazer o download e instalar a mesma arquitetura para o Ubuntu como você usou ao instalar o Windows. Se você tem o Win7 64bit, você deve baixar e instalar a imagem iso de 64 bits do Ubuntu para o instalador do wubi. Se o Win7 tiver uma versão de 32 bits, escolha a imagem iso da área de trabalho do Ubuntu 32bit da lista de imagens iso disponíveis para o Ubuntu 12.04 .
Para poder instalar o Ubuntu 12.04 mais facilmente usando o wubi.exe, você deve primeiro baixar o instalador do wubi e sua imagem favorita do Ubuntu, colocar os dois arquivos em uma pasta temporária na área de trabalho e iniciar o instalador do wubi dentro dessa pasta temporária. . Após a reinicialização, permita que o instalador conclua a instalação do Ubuntu, e somente após uma segunda reinicialização, você poderá escolher o Ubuntu na lista do menu de inicialização e, esperamos, inicializar em seu recém-instalado Ubuntu 12.04 LTS.
Leia este Guia do Wubi , pode ser útil para você.