No tipo de terminal:
chmod u+x filename.sh
então:
./filename.sh
O arquivo deve ter permissão de execução. (Feito com chmod u + x).
Eu tenho problemas para abrir um arquivo .sh para o Cytoscape no Ubuntu 13.10. Eu clico nele mas não faz nada! Quando tento usar o terminal, ele abre, mas mostra muitos códigos e não é executado. Desculpe se esta uma pergunta boba eu sou novo para o Ubuntu.
No tipo de terminal:
chmod u+x filename.sh
então:
./filename.sh
O arquivo deve ter permissão de execução. (Feito com chmod u + x).
Eu tive o mesmo problema e alterar o bit de execução não foi a resposta. Por algum motivo, o script de shell diz que não consegue encontrar o servidor X-windows. Eu pensei que poderia ser devido ao Ubuntu usando Unity ou Compiz, mas não.
O problema é que o OpenJDK não funciona por qualquer motivo. Eu tinha desinstalado o Oracle Java. Então eu fiz o download do java.com, instalei em /usr/java/jre1.7.0_55 , criei links simbólicos de tudo em /usr/java/jre1.7.0_55/bin to /usr/local/bin e o instalador do Cyto funcionou. Ele colocou seu elemento run na seção "Other" Application Menu.
Estou executando em uma plataforma de 64 bits, o que também pode ser um problema de contribuição.