Hipoteticamente sim, mas pode haver alguns problemas. Eu não recomendaria usar um formato de arquivo projetado para sistemas operacionais Windows para implantar um sistema Linux, embora eu entenda por que isso pode ser tentador. Considere o uso de .tar em vez de .wim.
Problema # 1 = O Grub2 Boot Manager não será instalado, portanto, você não terá como inicializar o sistema implantado, embora o "boot-repair" executado a partir de um livecd possa corrigir isso.
Para instalar o uso de reparo de inicialização:
sudo apt-get install boot-repair
Para executar o uso de reparo de inicialização:
boot-repair
Problema # 2 = Não há muitos programas disponíveis para criar wims, então você provavelmente terá que usar o imagex ou dism ambos dos quais estão disponíveis apenas para sistemas operacionais Windows. Eu suponho que você possa usar o p7zip (a versão linux do 7-zip se ele suportar o wim?), Mas ele não usará compressão. Se você usar o dism ou o imagex, o Windows não poderá ler sistemas ext2 / ext3 / ext4, portanto, você não poderá criar uma imagem se não puder acessar a partição. Você pode ser capaz de executar dism ou imagex no Wine ou pode instalar um driver especial no Windows como o que o Paragon faz, ou há outro que não consigo lembrar o nome de adicionar suporte ao sistema de arquivos para o Windows. Também vale a pena notar que o imagex não suporta atributos estendidos, que acredito que o Ubuntu usa.
Problema # 3 = O .wim será capaz de manter as permissões do arquivo linux. Se não for o seu sistema implantado, todos os arquivos pertencentes a qualquer usuário extrairão o .wim, o que deixaria seu sistema muito desprotegido, já que os sistemas Linux dependem quase inteiramente de permissões de arquivos para se proteger de vírus e hackers. Isso também pode afetar a capacidade do sistema de executar? Será que será capaz de ler certos tipos de arquivos linux que não são suportados no Windows?
Problema # 4 = Quando você implanta em um novo disco rígido, o gerenciador de inicialização Grub2 se lembra do UUID da unidade que você instalou. Você não poderá inicializar em nenhum outro sistema, a menos que você use um live cd do linux para alterar o UUID da partição que você está implantando para corresponder ao UUID da unidade original. Você pode fazer isso com tune2fs.
Para encontrar o UUID da sua partição de origem, use:
sudo blkid
Para alterar o UUID da partição que está sendo implantada para uso:
sudo tune2fs /dev/sda1 -U theuuidgoeshere