Sim, é possivel. Quando você instala o ubuntu, escolha 'Manual partitioning': - Crie uma nova partição no seu SSD e selecione como ponto de montagem '/' - Crie uma nova partição no seu HD e selecione como ponto de montagem '/ home'
Se você deseja mais informações sobre criação de pontos e pontos de montagem: ajuda - particionamento problema ou Particionamento / Home .