Ao instalar o Ubuntu, siga as instruções de instalação padrão e, quando chegar ao item 4, pegue "outra coisa".
Em seguida, aloque uma partição com um tamanho igual ao dobro da sua RAM para "trocar" e aloque o resto do seu SSD para "/" e aloque todo o seu HDD para "/ home".
Quando configurar o squid , remova o comentário do diretório de cache de disco #cache_dir ufs /usr/local/squid/var/cache/squid
e defina para cache_dir ufs /home/squid/cache
Defina todas as outras opções de acordo com o manual de configuração da sua versão.