Os vírus podem ser executados no Wine?
Sim.
A inserção de um CD com um vírus habilitado para execução automática em um computador Ubuntu + Wine leva ao carregamento do vírus e à infecção do computador?
Não. Você poderia habilitar esse tipo de script de execução automática se você realmente tentasse, mas não é algo com o qual o Ubuntu seja enviado.
O que acontece se você administrar um vírus no Wine?
O que acontece se você administrar qualquer coisa através do vinho? Um vírus é apenas uma aplicação que faz coisas particulares. Se o vinho sustentar essas coisas, elas funcionarão como planejadas. Se o vinho não, você vai ver um monte de erros confusos.
Realmente não é possível dar uma resposta que cubra todos os vírus.
Eu geralmente considero melhor apenas evitá-los em primeiro lugar.
O que um vírus executa sob o Wine tem acesso?
Tendo visto outra resposta afirmando que o Wine não pode machucar nada, acho importante acrescentar que isso não é verdade. O vinho tem acesso a mais do que o suficiente para arruinar o seu dia.
Para sua conveniência, seu diretório pessoal é vinculado a Meus Documentos. Isso significa que você pode salvar as coisas facilmente dos aplicativos Wine, mas também significa que até mesmo um vírus básico poderia, por exemplo, criptografar todos os seus documentos do Ubuntu e mantê-los como reféns.