Eu suponho que estes são drives USB. Se este for o caso, então você está obrigado a diminuir a velocidade de cópia. Velocidades de disco, tamanho de arquivo, contagem de arquivos, comprimento do caminho de arquivo, todos são reproduzidos em velocidades de cópia. Os dados CIFS geralmente são mais lentos para serem copiados do que os dados do NFS. Existem muitos fatores envolvidos. Se esses dados forem CIFS, tente RichCopy multithreaded. Se este é um dado NFS, então fique com o rsync.