Execute 'update-manager -c -d'
Mas, honestamente, não se incomode. Fazer backup de tudo em sua pasta pessoal e fazer a instalação nova, acredite muito mais fácil e mais rápido.
Fazer backup de tudo é um exagero, mas esse método garante que nada de importante para você seja esquecido.
Execute esta etapa mesmo se você fosse um usuário responsável e estivesse executando suas tarefas fazendo o backup de qualquer maneira.
Sim, você vai perder algumas configurações, mas elas são diferentes de qualquer maneira.