Se você tiver dois discos rígidos dos quais deseja inicializar, poderá escolher o dispositivo de inicialização através do menu de inicialização do BIOS. Para entrar no menu do BIOS, pressione esc
ou F-something
durante a inicialização (depende do sistema). Em seguida, selecione o disco rígido que você deseja inicializar. As BIOS são muito específicas do sistema, por isso não posso fornecer instruções muito mais detalhadas.
Se eu leio sua pergunta corretamente, você quer ter uma unidade com o Windows instalado e colocá-la em outro computador. Tenho certeza que isso não funcionará. Você teria que reinstalar o Windows depois de colocá-lo na nova máquina.