Eu corro o Ubuntu, não o Xubuntu. No entanto, para resolver o seu problema, realizei uma nova instalação do Xubuntu. Após a instalação (a propósito, eu costumo executar comandos cli quando possível). Eu executei o seguinte:
$ sudo apt-get install wine
Então eu encontrei "Wine" no menu suspenso. No Wine eu encontrei "Configure Wine". Clicar em Configurar o Wine abrirá a GUI de configuração.
Isso foi feito no Xubuntu 13.10.
Se isso não funcionar para você, sugiro que você considere o uso do cli para instalar o Wine:
Experimente estes comandos:
$ sudo apt-get remove --purge wine
$ sudo apt-get install wine
Isso deve dar a você os padrões que eu tenho. Se isso falhar, pode haver um problema com a instalação do seu Xubuntu.
Vou verificar se existe uma diferença entre esta instalação 13.10 e a atual 14.04. Se achar diferente, atualizarei esta resposta.