Porque apt-get
está armazenando em cache os pacotes baixados em /var/cache/apt/archives/
e /var/cache/apt/archives/partial/
.
Se você quiser instalar um pacote apt-get
primeiro procura o cache e só faz o download do pacote novamente se não encontrar esse pacote no cache.
Para esvaziar o cache, você precisa emitir um apt-get clean
.