Não, a criptografia da unidade não é o problema. Violações das regras são o problema.
Primeiro, certifique-se de que nenhuma das partições no disco esteja montada, com
mount | grep -E "/dev"
sudo umount
de cada uma das partições do disco.
Depois, como você está tentando obter acesso direto à estrutura do disco, execute seu comando como root
:
sudo dd ......
ou
sudo shred ......