O Geant4 10.4 é um poderoso aplicativo complexo para as áreas de física, matemática e engenharia. Talvez você deva rever cuidadosamente o procedimento de instalação aqui específico do Ubuntu 18.04 e verificar as dependências, etc.
Os erros que você postou indicam claramente que a estrutura de diretórios esperada não foi criada.