Se você quiser ter uma tela de seleção de inicialização para escolher o sistema operacional, instale o Ubuntu no segundo SSD e durante a instalação aponte o instalador para colocar o GRUB na mesma unidade (segundo SSD). Tenho quase 100% de certeza que, desta forma, se você remover o segundo SSD, o gerenciador de inicialização do Windows permanecerá no primeiro SSD, permitindo inicializar o Windows como antes. Então não coloque o GRUB no primeiro SSD!
Mesmo se você quisesse instalar o GRUB no segundo SSD, mas selecionando qual unidade (e esse sistema operacional) inicializaria da BIOS, quando você selecionaria o segundo SSD, veria a seleção do Windows lá, porque quando o GRUB é instalado, ele procura por todos os sistemas operacionais em um computador e lista todos eles.