Suponho que você tenha instalado o eclipse apenas extraindo arquivos. Se este for o caso, você pode simplesmente excluir os arquivos extraídos.
se você executou algum script install.sh e não encontrou uninstall.sh, digite os seguintes comandos
whereis eclipse
which eclipse
Por isso você terá idéia de onde os arquivos estão instalados e, portanto, você pode remover esses arquivos. Se você está vendo a entrada de seu software para o desktop órfão, então leia isto
O eclipse também armazena seus arquivos de configuração na pasta ~ / .eclipse que você pode querer remover, pois eles podem colidir com a instalação do eclipse a partir do apt repos
EDITAR: -
se a variável de ambiente estiver definida em ~ / .bashrc e ~ / .profile e, em alguns casos, / etc / environment. você pode desanexar os