A notificação só desaparece depois que você move o mouse ou digita algo. Se você sair do seu computador, as notificações continuarão aparecendo quando você voltar.
Para as notificações que desapareceram, você pode clicar na data na sua barra superior e ela mostrará uma lista das últimas notificações para que você possa lê-las novamente. Você verá um ponto ao lado da data em que há novas notificações.