Eu suspeito que a correção é a mesma de antes, mas a variável xdg mudou para o Ubuntu: GNOME
Eu lembro que este é um problema em 17.10, mas não consigo encontrar a resposta que funcionou naquela época.
Basicamente, o indicador que mostrava a quantidade de mensagens no topo dos ícones do dock no Unity se foi (hexchat, skype, etc), e embora haja algumas soluções para o Gnome como este Os ícones do indicador não aparecem após a atualização para o Ubuntu 17.10 ou mesmo este link (usando export XDG_CURRENT_DESKTOP=Unity nos respectivos arquivos .desktop), esses não parecem funcionar para o Unity ou não estão funcionando para esta última versão. Até agora, parece ser o único problema que encontrei durante a transição de 17,10 para 18,04.
O que devo tentar em seguida?
Eu suspeito que a correção é a mesma de antes, mas a variável xdg mudou para o Ubuntu: GNOME